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Inicio Revista Colombiana de Cancerología Variantes genéticas comunes en el gen TEP1 (locus 14q11.2) y en el gen TK1 (loc...
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Información de la revista
Vol. 21. Núm. 1.
Páginas 1-82 Zapatos STAR Kids KIDS Chuck ALL Taylor Converse Zapatos ALR34j5q (Enero - Marzo 2017)
DOI: 10.1016/j.rccan.2017.02.058
Acceso a texto completo
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Variantes genéticas comunes en el gen TEP1 (locus 14q11.2) y en el gen TK1 (locus 17q25.3) están asociadas al riesgo de tumores colorrectales en latinos
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María Carolina Sanabria Salas a , b ,
Autor para correspondencia
csanabria@cancer.gov.co Zapatos STAR Kids KIDS Chuck ALL Taylor Converse Zapatos ALR34j5q

Autor para correspondencia.
, Jovanny Zabaleta c Zapatos STAR Kids KIDS Chuck ALL Taylor Converse Zapatos ALR34j5q , Adriana Umaña Pérez b , Konrad Rawlik d , Albert Tenesa d , Martha Lucía Serrano López a , b , Myriam Sánchez de Gómez b , Martha Patricia Rojas a Zapatos STAR Kids KIDS Chuck ALL Taylor Converse Zapatos ALR34j5q , Luis Eduardo Bravo e , Gustavo Hernández Suárez a
a Grupo Área de Investigaciones, Instituto Nacional de Cancerología, Bogotá D. C., Colombia
b Grupo de Investigación en Hormonas, Universidad Nacional de Colombia, Bogotá D. C., Colombia
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c Translational Genomics Core, Louisiana State University, New Orleans, U.S.A.
d Genetics and Genomics, Roslin Insitute – University of Edimburgh, Edimburgh, UK
e Registro Poblacional de Cáncer de Cali, Universidad del Valle, Cali, Colombia
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Introducción: Se han identificado 63 variantes comunes de riesgo asociadas con cáncer colorrectal (CCR) en estudios de genoma completo (GWAS) en poblaciones europeas y asiáticas, y los genes de alta penetrancia son responsables del 5% de los casos. Juntos no explican la heredabilidad en CCR (∼ 35%).

Objetivo: Descubrir nuevas variantes comunes asociadas al riesgo de tumores colorrectales aprovechando el alto grado de mezcla de poblaciones latinas.

Materiales y métodos: Se realizó análisis de asociación de genes candidatos (CG) y GWAS en un estudio que incluyó 313 casos de CCR, 200 casos de pólipos adenomatosos (PA) y 506 controles de seis ciudades colombianas. Se evaluó el papel de estas variantes comunes mediante análisis básicos de asociación por SNP (X 2 ) y regresiones logísticas ajustadas por edad y ancestría. Los SNP seleccionados fueron genotipados por TaqMan en muestras adicionales.

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Resultados: La ancestría europea se asoció al riesgo de PA, mientras que la ancestría africana se asoció al riesgo de PA y CCR (P ≤ 0,01). En los análisis de regresión logística ajustados del estudio CG, el alelo menor (A) del SNP 14q11.2:rs1760898 (C/A) se asoció al riesgo de CCR (OR 0,48; 95% CI 0,33-0,69; P nominal=6,8 x 10-5GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas GuiriKnowsCalabasas Ybf7gv6y; P 1.000 permutaciones=0,03); esta asociación se mantuvo en los análisis con muestras adicionales (P =0,01). En los análisis básicos de asociación por SNP (X 2 ) del estudio tipo GWAS, el alelo menor (A) del SNP 17q25.3:rs1065768 (G/A) se asoció al riesgo de PA (OR 0,35, 95% CI 0,24-0,51; P nominal=3,4 x 10-8; P corregida por Bonferroni=0,02). Esta asociación persistió después de realizar un ajuste por edad, proporciones de ancestría (globales, en el cromosoma 17 y en el locus 17q25) y los 10 primeros componentes principales (PC) de la variabilidad genética (P =Zapatos STAR Kids KIDS Chuck ALL Taylor Converse Zapatos ALR34j5q 3,6 x 10-4); igualmente, se mantuvo en los análisis con muestras adicionales (P =9,5 x 10-5).

Conclusiones:Zapatos STAR Kids KIDS Chuck ALL Taylor Converse Zapatos ALR34j5q El SNP rs1760898 (TEP1, Telomerase Associated Protein 1) confiere un cambio de Asparagina (Asn) por Lisina (Lys) dentro del dominio TROVE de unión a RNA; este cambio podría afectar la actividad de la telomerasa importante en cáncer. El SNP rs1065768 (3’UTR TK1, Thymidine kinase 1) podría afectar la estabilidad del mRNA y producción proteíca de TK1, importante en la síntesis de DNA. Estos resultados son un aporte importante para avanzar en el entendimiento de las bases biológicas del desarrollo tumoral colorrectal y contribuyen al conocimiento general del papel de la heredabilidad en CCR.

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